98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0234 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0234  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0156  hypothetical protein  72.43 
 
 
186 aa  287  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33412  normal  0.373382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0378  hypothetical protein  70.49 
 
 
185 aa  277  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2020  hypothetical protein  68.85 
 
 
185 aa  274  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30864  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2250  hypothetical protein  63.98 
 
 
188 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0243892  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0410  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.75 
 
 
183 aa  243  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3928  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.99 
 
 
188 aa  237  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3587  hypothetical protein  62.84 
 
 
184 aa  237  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.928293  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0878  hypothetical protein  57.71 
 
 
184 aa  217  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4022  redoxin domain-containing protein  56.04 
 
 
183 aa  217  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_002978  WD1250  hypothetical protein  53.23 
 
 
190 aa  203  1e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6604  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.65 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1408  redoxin domain-containing protein  53.89 
 
 
181 aa  193  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0096  hypothetical protein  52.69 
 
 
194 aa  193  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0147  hypothetical protein  50.54 
 
 
193 aa  190  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0321  redoxin  50.56 
 
 
185 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1940  redoxin domain-containing protein  46.77 
 
 
217 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0884  hypothetical protein  44.81 
 
 
176 aa  160  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.231284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.09 
 
 
185 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0950  redoxin domain-containing protein  45.36 
 
 
185 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626081  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2478  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.45 
 
 
194 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.02 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1614  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.2 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3487  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.7 
 
 
187 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07195  hypothetical protein  44.63 
 
 
185 aa  144  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.825172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2156  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.43 
 
 
187 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0955  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.39 
 
 
193 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143271 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1427  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.05 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1367  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  42.05 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.150367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4031  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.5 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0446  redoxin domain-containing protein  40.32 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0989  hypothetical protein  42.93 
 
 
193 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00594634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4240  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.85 
 
 
193 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1545  hypothetical protein  42.37 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4302  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.85 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1730  hypothetical protein  41.94 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1291  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.62 
 
 
193 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3842  redoxin  41.94 
 
 
193 aa  131  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1438  hypothetical protein  41.81 
 
 
185 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2389  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.95 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0343728  normal  0.47432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1461  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.25 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000703412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0678  hypothetical protein  41.05 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182465  unclonable  0.0000000142494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3065  hypothetical protein  40.22 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.57 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2915  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00018662  normal  0.0183132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0232  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.04 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0970667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5009  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.25 
 
 
192 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2194  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.94 
 
 
184 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0321  hypothetical protein  38.15 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0455  hypothetical protein  40.31 
 
 
203 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11749  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  117  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208132 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0553  hypothetical protein  42.39 
 
 
191 aa  117  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0708  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.39 
 
 
191 aa  117  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851081  hitchhiker  0.00000125723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2152  Redoxin domain protein  38.22 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.130156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1976  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  38.25 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1342  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.9 
 
 
187 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0921  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.36 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03071  hypothetical protein  39.33 
 
 
197 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1351  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.21 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0035  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.99 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03061  hypothetical protein  39.33 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0285  hypothetical protein  38.67 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3526  Redoxin domain protein  37.77 
 
 
196 aa  108  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00360773  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03161  hypothetical protein  39.33 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2855  Redoxin domain protein  37.7 
 
 
193 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1889  hypothetical protein  39.07 
 
 
183 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000437946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2254  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.85 
 
 
188 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0043335  normal  0.0136474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.56 
 
 
206 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1318  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
199 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.845811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.69 
 
 
374 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03101  hypothetical protein  32.32 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.341385  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25151  hypothetical protein  32.69 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0242  hypothetical protein  33.12 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1649  hypothetical protein  33.77 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.64 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154334  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03631  hypothetical protein  33.77 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0871591  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0215  hypothetical protein  32.18 
 
 
194 aa  89  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  30.41 
 
 
377 aa  88.2  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.44 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.527569  normal  0.0758496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4144  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.46 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0627  hypothetical protein  30.16 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.650522  normal  0.426152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06425  hypothetical protein  31.44 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.11 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5923  putative thiol-disulfide isomerase  32.16 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0067  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.84 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717599  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0757  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  25.33 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6629  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.32 
 
 
218 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3882  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.15 
 
 
203 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15096  normal  0.0199402 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  26.67 
 
 
677 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.42 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2145  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.459175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1488  hypothetical protein  24.46 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0230  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  29.09 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.242968  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.18 
 
 
678 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
154 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516119  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1676  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.05 
 
 
152 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>