More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0207 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  45.16 
 
 		 733 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  46.23 
 
 		 731 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  53.34 
 
 		 712 aa  769    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  53.11 
 
 		 718 aa  779    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 707 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  100 
 
 		 734 aa  1500    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 711 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  52.34 
 
 		 712 aa  779    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  45.44 
 
 		 731 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  44.79 
 
 		 704 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  46.79 
 
 		 762 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  41.28 
 
 		 718 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  43.94 
 
 		 704 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  43.87 
 
 		 725 aa  623  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  43.26 
 
 		 723 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  43.53 
 
 		 721 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  40.65 
 
 		 720 aa  611  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  43.36 
 
 		 721 aa  612  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  44.3 
 
 		 719 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  42.22 
 
 		 737 aa  599  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  42.5 
 
 		 767 aa  599  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  43.43 
 
 		 725 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  43.71 
 
 		 726 aa  602  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  42.76 
 
 		 718 aa  599  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  43.43 
 
 		 725 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  43.43 
 
 		 725 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  43.43 
 
 		 725 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  42.62 
 
 		 718 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  43.04 
 
 		 723 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 726 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  42.02 
 
 		 725 aa  594  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  42.71 
 
 		 725 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  43.14 
 
 		 725 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  42.98 
 
 		 738 aa  591  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  42.64 
 
 		 721 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  40.41 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  43.22 
 
 		 725 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  43.43 
 
 		 725 aa  592  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  44.35 
 
 		 718 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  41.61 
 
 		 726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  44.35 
 
 		 718 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  41.3 
 
 		 734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  44.2 
 
 		 718 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  42.92 
 
 		 718 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  41.74 
 
 		 725 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  40.36 
 
 		 738 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  40.34 
 
 		 740 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  42.35 
 
 		 756 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  40.96 
 
 		 743 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  41.74 
 
 		 727 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  39.61 
 
 		 920 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  40.29 
 
 		 730 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  39.66 
 
 		 722 aa  545  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  40.96 
 
 		 716 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  40.77 
 
 		 718 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  40.15 
 
 		 687 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  39.41 
 
 		 776 aa  522  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  40.68 
 
 		 719 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  39.35 
 
 		 727 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  40.59 
 
 		 726 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.53 
 
 		 694 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  39.07 
 
 		 711 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  36.48 
 
 		 733 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  41.08 
 
 		 739 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  35.47 
 
 		 713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  35.89 
 
 		 719 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  38.32 
 
 		 718 aa  438  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  35.49 
 
 		 723 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  36.73 
 
 		 722 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  35.3 
 
 		 779 aa  429  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  32.03 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  32.03 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  34.1 
 
 		 720 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  32.73 
 
 		 706 aa  363  8e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  31.63 
 
 		 871 aa  361  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  33.74 
 
 		 701 aa  360  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 		 763 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.21 
 
 		 763 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  30.22 
 
 		 730 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  31.6 
 
 		 729 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  30.68 
 
 		 744 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.76 
 
 		 722 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.32 
 
 		 750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  32.73 
 
 		 700 aa  336  7.999999999999999e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  30.66 
 
 		 744 aa  335  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  30.68 
 
 		 724 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  30.68 
 
 		 724 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  33.33 
 
 		 731 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  31.34 
 
 		 742 aa  329  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  31.11 
 
 		 722 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 1000 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  30.5 
 
 		 722 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.6 
 
 		 721 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  30.65 
 
 		 722 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  30.35 
 
 		 722 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  30 
 
 		 726 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.89 
 
 		 739 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.85 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>