More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0193 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  51.74 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  51.16 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  52.73 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  53.7 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  53.12 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  52.41 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  50.93 
 
 		 169 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  53.42 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  53.05 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  52.12 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  51.52 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  53.42 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  52.12 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  52.5 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  51.19 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  52.47 
 
 		 169 aa  177  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  51.55 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  52.17 
 
 		 170 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  54.07 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  51.19 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  53.7 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  51.79 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  52.17 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  52.17 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  52.17 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  50.61 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  52.8 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  52.8 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  50.6 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  52.17 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  50.6 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  50.93 
 
 		 170 aa  173  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  51.95 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  49.38 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  51.55 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  51.55 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  51.55 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  51.55 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  51.85 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  51.55 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  51.85 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  52.6 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  52.47 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  49.7 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  51.85 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  49.41 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  52.17 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  49.7 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  52.8 
 
 		 178 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  50.31 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  48.82 
 
 		 171 aa  170  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  47.93 
 
 		 170 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  52.47 
 
 		 167 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  51.53 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  51.85 
 
 		 216 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  53.09 
 
 		 175 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  51.53 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  46.99 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  53.9 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  52.47 
 
 		 196 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  51.85 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  51.85 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  51.85 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  51.23 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  52.47 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  51.55 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  51.23 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  48.52 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  49.4 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  51.85 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  51.85 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  51.23 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  49.7 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  48.3 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  51.85 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  52.44 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>