More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0182 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  100 
 
 		 279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  54.8 
 
 		 280 aa  304  9.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  54.77 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  55.08 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  54.94 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  55.42 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  54.94 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  52.26 
 
 		 199 aa  222  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_4708  predicted protein  48.4 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  41.67 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  39.47 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  40.74 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  37.8 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  41.42 
 
 		 243 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  36.4 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  36.51 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  40.5 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  36.68 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  35.74 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  40.85 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  36.52 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  32.38 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  33.88 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  35.1 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  35.34 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  32.38 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  34.14 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  35.95 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  33.6 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  33.73 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  33.08 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  33.08 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  34.76 
 
 		 326 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  34.76 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  33.7 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  35.1 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  34.76 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  34.55 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  35.1 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  33.7 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  34.76 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  35.65 
 
 		 310 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  36.68 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  34.8 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  34.02 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  37.83 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  41.07 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  35.22 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  34.76 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  34.69 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  34.01 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  35.22 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  38.84 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  33.6 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  35.71 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  33.46 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  33.2 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  33.73 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  33.47 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  32.11 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  32.52 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  40.99 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  33.73 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  33.46 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  34.5 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  36.05 
 
 		 309 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  34.35 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  32.81 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  34.06 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  34.38 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  36.78 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  34.78 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  33.06 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>