More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0151 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  55.56 
 
 
180 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  58.93 
 
 
189 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  55.25 
 
 
183 aa  207  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  55.56 
 
 
182 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  57.31 
 
 
181 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  55.23 
 
 
180 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  54.75 
 
 
177 aa  205  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  54.19 
 
 
184 aa  204  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  53.63 
 
 
182 aa  204  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  54.39 
 
 
192 aa  203  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  54.97 
 
 
181 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  53.49 
 
 
181 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.45 
 
 
185 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  52.05 
 
 
184 aa  198  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  53.67 
 
 
179 aa  198  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  53.22 
 
 
182 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  52.05 
 
 
184 aa  198  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  53.22 
 
 
182 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  53.22 
 
 
182 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  52.3 
 
 
176 aa  198  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  52.05 
 
 
184 aa  198  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  52.05 
 
 
184 aa  198  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  52.63 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  53.67 
 
 
185 aa  197  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  52.05 
 
 
293 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  52.33 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  52.05 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  52.38 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  52.38 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  52.63 
 
 
180 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  52.05 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  51.74 
 
 
177 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  52.63 
 
 
180 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  52.05 
 
 
256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  53.76 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  52.66 
 
 
176 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  191  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  49.44 
 
 
182 aa  191  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  51.16 
 
 
179 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  51.15 
 
 
184 aa  191  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  48.88 
 
 
182 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  50.29 
 
 
182 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  48.88 
 
 
182 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  48.31 
 
 
182 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  48.88 
 
 
182 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  50.29 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  50.29 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  51.12 
 
 
181 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  52.33 
 
 
182 aa  187  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  49.71 
 
 
182 aa  187  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  50 
 
 
182 aa  186  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  50.58 
 
 
185 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  53.22 
 
 
182 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  49.71 
 
 
184 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  50.58 
 
 
178 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  52.91 
 
 
180 aa  185  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  52.91 
 
 
180 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  52.91 
 
 
180 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  47.37 
 
 
179 aa  184  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  50 
 
 
180 aa  181  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  51.43 
 
 
180 aa  181  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  50.87 
 
 
187 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  51.46 
 
 
184 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  48.24 
 
 
178 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  45.66 
 
 
181 aa  177  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  47.13 
 
 
180 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  48.54 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  45.66 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  45.03 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  45.03 
 
 
187 aa  170  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  44.44 
 
 
176 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  44.19 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  46.59 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44 
 
 
177 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.43 
 
 
177 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  45.88 
 
 
169 aa  159  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  46.2 
 
 
175 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  46.02 
 
 
179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  44.69 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  45.4 
 
 
177 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  43.45 
 
 
175 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 
175 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  42.86 
 
 
175 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  43.58 
 
 
174 aa  150  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  45.56 
 
 
177 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  41.57 
 
 
170 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  45.14 
 
 
174 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  40.22 
 
 
182 aa  147  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  40.78 
 
 
182 aa  147  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  40.22 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  46.01 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  36.67 
 
 
183 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  38.37 
 
 
171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  46.3 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  44.44 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  42.05 
 
 
174 aa  144  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  44.44 
 
 
174 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  42.35 
 
 
171 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  46.45 
 
 
174 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>