148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0147 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
350 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  48.22 
 
 
353 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  45.21 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  46.57 
 
 
340 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  46.57 
 
 
340 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 
410 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  44.05 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  43.28 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  44.51 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  44.25 
 
 
353 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 
363 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  45.4 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  45.4 
 
 
374 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.7 
 
 
394 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 
358 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  40.5 
 
 
393 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  43.6 
 
 
360 aa  262  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  43.49 
 
 
386 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
376 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  41.81 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 
374 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  41.59 
 
 
376 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  42.6 
 
 
377 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  41.44 
 
 
379 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  42.6 
 
 
378 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
378 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
381 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
378 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
378 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
381 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
378 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
378 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
398 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 
410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  36.34 
 
 
334 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  37.5 
 
 
334 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  37.5 
 
 
334 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  39.82 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  39.23 
 
 
346 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  38.64 
 
 
369 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  38.94 
 
 
338 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  36.64 
 
 
337 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  37.65 
 
 
338 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  37.14 
 
 
339 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  37.27 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  34.13 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  35.03 
 
 
316 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.24 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  34.31 
 
 
330 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  35.63 
 
 
331 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  36.59 
 
 
334 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  34.43 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  26.57 
 
 
375 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  27.57 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.5 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  29.28 
 
 
360 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  28.69 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.99 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.45 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  28.32 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  26.64 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  29.27 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.02 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  26.82 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.17 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  25.47 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  26.63 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  24.78 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  24.65 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  24.07 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  24 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.65 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  24.72 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.36 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  26.45 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  24.36 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.65 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.65 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  26.51 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.78 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  25 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.86 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>