273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0096 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  688    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  32.92 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.67 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  31.11 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.48 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.22 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  31.84 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.75 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  32.41 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  32.08 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.1 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  31.02 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.27 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.23 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.61 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  30.18 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  33.91 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  30.95 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  33.2 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.5 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  43.93 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  30.83 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.12 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.52 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  28.46 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.3 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.07 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.17 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  30.5 
 
 		 317 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.78 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  33 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  26.98 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  48.35 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.71 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.03 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  28.25 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.56 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  30 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.28 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  28.09 
 
 		 314 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  25.43 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  33.78 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  33.66 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.62 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  29.7 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  33.17 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  27.83 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  33.48 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  29.46 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  40 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  38.64 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  27.35 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  27.35 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  41.76 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.97 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.6 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.85 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.26 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.79 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  28.15 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  38.61 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  29.9 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.16 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  40.23 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  36.89 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.72 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.62 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.44 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.85 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  26.48 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  30.29 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.42 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34.95 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.78 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  47.62 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1126  hypothetical protein  36.96 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  47.62 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.45 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.97 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>