More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0089 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  56.84 
 
 		 259 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  42.08 
 
 		 271 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  42.53 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  42.05 
 
 		 249 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  41.38 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  39.47 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  42.53 
 
 		 260 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  38.95 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  40.34 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  41.48 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  40.34 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  40.57 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  40.34 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  37.36 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  40.23 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  38.33 
 
 		 261 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  37.64 
 
 		 278 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  37.64 
 
 		 256 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  36.84 
 
 		 252 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  37.5 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  36.26 
 
 		 284 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  35.03 
 
 		 261 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  35.03 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  35.03 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  34.83 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  35.39 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  35.39 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  35.39 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  36.52 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  35.39 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  35.39 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  34.27 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 295 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  33.7 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  36.36 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  34.83 
 
 		 260 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 267 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 257 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  33.7 
 
 		 295 aa  104  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 257 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  42.28 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  35.33 
 
 		 262 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  37 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.96 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  28.81 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.02 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.33 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.09 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.02 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.67 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.73 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.15 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  28.67 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  31 
 
 		 253 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.35 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.35 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>