More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0032 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  551  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  48.2 
 
 		 258 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  52.58 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.65 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  41.8 
 
 		 263 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.34 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  43.4 
 
 		 245 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.66 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  42.17 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  40.67 
 
 		 278 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.4 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.4 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.39 
 
 		 667 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.15 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  39.83 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.39 
 
 		 663 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  41.95 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.73 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.61 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.15 
 
 		 272 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  42.86 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.84 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.8 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.77 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.77 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.31 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.14 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  45.41 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.78 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  41.32 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.78 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  43.75 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41.53 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  42.67 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  43.17 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  39.34 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.39 
 
 		 673 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.35 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  38.84 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  41.05 
 
 		 268 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.86 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  39.84 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.6 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.98 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  43.3 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  42.73 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  39.18 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  38.63 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  42.98 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.18 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  39.18 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.98 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.39 
 
 		 668 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  40.57 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  39.18 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.93 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  43.11 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  41.88 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  38.78 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  39.51 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  35.97 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  38.78 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  38.78 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  40.17 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  39.36 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.39 
 
 		 657 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  41.36 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  42.98 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  39.59 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.44 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  35.97 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.89 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.89 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  41.38 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  41.52 
 
 		 297 aa  194  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.21 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.76 
 
 		 659 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.32 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.12 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  41.96 
 
 		 439 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  42.86 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  41.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  41.22 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.97 
 
 		 669 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>