88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0030 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 404 aa  798    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  43.85 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  42.82 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.98 
 
 		 574 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  30 
 
 		 577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  30.53 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2111  Sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0394035  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0002  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.61 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  28.46 
 
 		 636 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0086  sodium/hydrogen exchanger  23.5 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0068  sodium/hydrogen exchanger  23.32 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0002  sodium/hydrogen exchanger  23.32 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2974  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0215  hypothetical protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0002  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2916  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1627  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3395  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0068  sodium/hydrogen exchanger  23.24 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0058  sodium/hydrogen exchanger  22.8 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2113  Sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.397274  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0067  sodium/hydrogen exchanger  22.54 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3249  Sodium/hydrogen exchanger  22.8 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3065  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0001  hypothetical protein  24.75 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  26.44 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3620  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 838 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1547  Sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3337  Sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3169  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  23.77 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3494  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  26.56 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0651  hypothetical protein  22.48 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.04 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0667  hypothetical protein  22.69 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 637 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3162  hypothetical protein  24.53 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200774 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  22.53 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  22.47 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  22.47 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  28.07 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  21.41 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  19.94 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  21.41 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 		 622 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  19.94 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  19.94 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  21.13 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  19.94 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  19.94 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  21.88 
 
 		 760 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  24.35 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  24.46 
 
 		 682 aa  46.6  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.57 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  22.15 
 
 		 666 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  22.74 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  22.43 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  22.3 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  20.56 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 		 741 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  21.75 
 
 		 662 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.33 
 
 		 720 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  23.68 
 
 		 649 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  24.79 
 
 		 624 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  24.04 
 
 		 654 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.84 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  23.91 
 
 		 715 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.79 
 
 		 596 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.69 
 
 		 669 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  26.12 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.95 
 
 		 579 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.61 
 
 		 498 aa  43.1  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>