206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0020 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
381 aa  797    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
370 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
352 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
348 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  34.35 
 
 
342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  34.66 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
354 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 
348 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
348 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 
348 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
348 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
348 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 
348 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
348 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 
348 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  33.23 
 
 
363 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  31.17 
 
 
349 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
344 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  30.67 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
305 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  27.96 
 
 
357 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  32.09 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.72 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
273 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
295 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 
336 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 
264 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.46 
 
 
258 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
262 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 
274 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32.11 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
282 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  30.53 
 
 
306 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  26.98 
 
 
256 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
278 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 
310 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
254 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  26.85 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
628 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
1015 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.41 
 
 
318 aa  77  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  22.55 
 
 
673 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  22.55 
 
 
673 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  27.06 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  22.55 
 
 
673 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.06 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  22.53 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 
626 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  26.55 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.03 
 
 
617 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.03 
 
 
554 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 
627 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  23.44 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  26.57 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  26.57 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.03 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  25.11 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  21.54 
 
 
624 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 
224 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 
673 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 
298 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  19.2 
 
 
671 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>