53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0011 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  714    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  44.63 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  40.48 
 
 		 315 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  36.97 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  38.79 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  35.17 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  32.82 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  33.21 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  34.15 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  29.3 
 
 		 286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  31.38 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  28.57 
 
 		 426 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  28 
 
 		 426 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  28.96 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  25.6 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  25.91 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  24.76 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  26.64 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  25.22 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  24.28 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.39 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  26.69 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  25.48 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  25.19 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  24.77 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  26.67 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  24 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  23.08 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  25.28 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  26.34 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.81 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  24.91 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  24.64 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.28 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  22.82 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  26.37 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  24.33 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.32 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  25.53 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  25.27 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  23.56 
 
 		 400 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  27.07 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  26.63 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  23.2 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  22.94 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  22.36 
 
 		 553 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  23.03 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  25.64 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  22.84 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  23.08 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>