124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0010 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  59.38 
 
 
190 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  58.6 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  66.27 
 
 
188 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  56.42 
 
 
188 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  53.4 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  54.74 
 
 
192 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  57.87 
 
 
193 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  55.56 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  54.7 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  54.7 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  55.8 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  56.91 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  56.91 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  56.91 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  56.91 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  54.75 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  53.19 
 
 
188 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  59.51 
 
 
181 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  54.88 
 
 
191 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  39.59 
 
 
210 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  41.57 
 
 
177 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  51.37 
 
 
203 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  39.67 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  41.76 
 
 
178 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  45.56 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  118  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  40.89 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  38.65 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  38.82 
 
 
182 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  40.82 
 
 
234 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  33.77 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  30.54 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  29.91 
 
 
230 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 
185 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  28.07 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  32.38 
 
 
257 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  30.54 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  28.4 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  26.67 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  27.74 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  35.85 
 
 
233 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  27.74 
 
 
195 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  29.22 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  29.87 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  35.34 
 
 
274 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  27.27 
 
 
299 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  27.1 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  27.92 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  30 
 
 
222 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  25.6 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  34.04 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  25.93 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  29.76 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  28.1 
 
 
301 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  27.92 
 
 
301 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  26.32 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  28.57 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  31.43 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  29.91 
 
 
297 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  23.87 
 
 
195 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  26.85 
 
 
231 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  26.67 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  26.67 
 
 
185 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  29.08 
 
 
185 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  23.87 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  26.67 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  30.4 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  24.52 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  25.69 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  25.69 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  25.69 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  25.69 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  25.69 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  25.69 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  25.69 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  26.57 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  23.87 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  27.08 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  31.91 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  27.08 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  27.08 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  27.08 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  25.81 
 
 
195 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  24.52 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  24.68 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  22.58 
 
 
229 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  24.52 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  25.69 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  25.69 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  25.56 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  25.69 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  26.39 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  27.21 
 
 
225 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  26.39 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>