More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3578 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  84.74 
 
 
319 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  82.35 
 
 
310 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  78.96 
 
 
310 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  74.35 
 
 
310 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  72.94 
 
 
348 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  75 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  71.43 
 
 
346 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  75.24 
 
 
329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  70.92 
 
 
340 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  68.85 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  69.16 
 
 
313 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  66.78 
 
 
318 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  69.06 
 
 
332 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  69.97 
 
 
330 aa  428  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  68.3 
 
 
310 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  70.97 
 
 
317 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  69.41 
 
 
333 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  71.48 
 
 
327 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
318 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  68.63 
 
 
336 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  66.99 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  71.62 
 
 
325 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  69.93 
 
 
344 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  65.03 
 
 
330 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  67.97 
 
 
333 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  67.97 
 
 
333 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  67.97 
 
 
333 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  67.87 
 
 
331 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  63.52 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  63.16 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  66.78 
 
 
335 aa  401  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  64.59 
 
 
330 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  68.47 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  68.15 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  69.21 
 
 
325 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  69.87 
 
 
329 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  63.93 
 
 
318 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  67.84 
 
 
327 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  61.44 
 
 
320 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  61.61 
 
 
361 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  60.19 
 
 
313 aa  378  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  60.86 
 
 
334 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  62.95 
 
 
325 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  58.96 
 
 
319 aa  359  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  55.26 
 
 
334 aa  358  5e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.28 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.28 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
456 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.68 
 
 
332 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  56.58 
 
 
325 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  54.17 
 
 
453 aa  347  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  56.54 
 
 
311 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  56.91 
 
 
320 aa  342  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  56.96 
 
 
325 aa  342  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  53.7 
 
 
461 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  53.7 
 
 
461 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  55.92 
 
 
311 aa  340  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
314 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  56.86 
 
 
311 aa  340  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  53.23 
 
 
460 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  55.74 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  50.6 
 
 
339 aa  338  5e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  55.34 
 
 
458 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  54.75 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  55.08 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  53.33 
 
 
314 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
312 aa  331  1e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  51.4 
 
 
323 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  51.4 
 
 
323 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  52.06 
 
 
319 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  56.82 
 
 
314 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  53.57 
 
 
345 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.81 
 
 
312 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  55.1 
 
 
314 aa  325  6e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  56.58 
 
 
320 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  54.87 
 
 
320 aa  325  7e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.63 
 
 
311 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.81 
 
 
317 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
324 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  53.18 
 
 
335 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.96 
 
 
321 aa  318  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  50 
 
 
314 aa  318  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  50.16 
 
 
326 aa  318  7.999999999999999e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
320 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
316 aa  317  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  52.4 
 
 
331 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  55.52 
 
 
321 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.95 
 
 
321 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  52.7 
 
 
320 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  51.15 
 
 
315 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
316 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
324 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  52.87 
 
 
313 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  51.32 
 
 
322 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
320 aa  316  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  54.1 
 
 
318 aa  315  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  52.7 
 
 
320 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
317 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
321 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>