More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3544 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 364 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  69.42 
 
 		 365 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.2 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  49.2 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.4 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  47.48 
 
 		 379 aa  332  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.96 
 
 		 386 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.75 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.62 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.27 
 
 		 378 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.67 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.18 
 
 		 376 aa  312  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  45.04 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.97 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.58 
 
 		 374 aa  305  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.55 
 
 		 374 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.3 
 
 		 377 aa  305  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  44.78 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.54 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  44.5 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  44.65 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.3 
 
 		 388 aa  299  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.67 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.01 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.01 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  43.01 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.96 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.64 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  42.71 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  42.38 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  42.36 
 
 		 374 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  42.75 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  43.36 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.07 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.2 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  40.77 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  44.95 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  42.78 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.51 
 
 		 377 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  36.39 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  34.5 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.34 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  38.65 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  34.41 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.15 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.57 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.57 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.81 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.26 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.23 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.32 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.73 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.9 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.95 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.52 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.87 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.51 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.15 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  25.97 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.96 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.96 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  26.09 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.07 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.46 
 
 		 382 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.3 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.45 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.73 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.14 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.23 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.75 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.56 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  24.61 
 
 		 377 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.46 
 
 		 372 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.75 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  26.53 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.79 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.63 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  25.6 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.32 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.01 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.01 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  31.61 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.68 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.88 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  25.8 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.06 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>