More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3514 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 468 aa  955    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  66.11 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.09 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.67 
 
 		 618 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.95 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.71 
 
 		 480 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  40.84 
 
 		 530 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.76 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.05 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.9 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.44 
 
 		 584 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.49 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.25 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  42.46 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.74 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  41.29 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.47 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.18 
 
 		 549 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.22 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.53 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.79 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  40.68 
 
 		 417 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 		 497 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  40.72 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.28 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  44.32 
 
 		 365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.84 
 
 		 509 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.63 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  33.19 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  38.59 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.2 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.89 
 
 		 619 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  30.58 
 
 		 734 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.36 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.5 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.7 
 
 		 643 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.52 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 		 573 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.23 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.09 
 
 		 625 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.5 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.05 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.8 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.52 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.95 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.41 
 
 		 540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.81 
 
 		 551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 		 1336 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.17 
 
 		 649 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.7 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  29.11 
 
 		 684 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.98 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.6 
 
 		 336 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.72 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.46 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.47 
 
 		 687 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.86 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.59 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.33 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.66 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.59 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.22 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 		 490 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 		 490 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.05 
 
 		 699 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.05 
 
 		 699 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.22 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.02 
 
 		 377 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.1 
 
 		 381 aa  143  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.93 
 
 		 701 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.09 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  33.57 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.09 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.86 
 
 		 522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 		 306 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.61 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.72 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.41 
 
 		 732 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.26 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  31.5 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.06 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.91 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.91 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.21 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  34.38 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.29 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.93 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.66 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.43 
 
 		 357 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.91 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.89 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.74 
 
 		 676 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.56 
 
 		 538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.47 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.89 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>