71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3510 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 348 aa  717    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  68.46 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  54.42 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  46.55 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  49.28 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  49.83 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  47.96 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  24.71 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  24.48 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 598 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  24.48 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  24.48 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  24.6 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  24.25 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.07 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  23.08 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 		 1001 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  28.47 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  23.91 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 258 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  23.15 
 
 		 615 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  23.15 
 
 		 615 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  25.39 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  22.78 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  22.33 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  22.77 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 244 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.4 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 626 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 		 276 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>