41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3509 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  100 
 
 
267 aa  511  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  63.82 
 
 
258 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  60.48 
 
 
286 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  55.68 
 
 
296 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  54.66 
 
 
273 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  55.56 
 
 
437 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  53.41 
 
 
256 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  52.02 
 
 
256 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  56.11 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  50.81 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  51.02 
 
 
269 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  49.37 
 
 
263 aa  208  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  47.06 
 
 
264 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  47.15 
 
 
282 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  46.69 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  46.72 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  41.6 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  46.69 
 
 
241 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  44.93 
 
 
293 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  44.4 
 
 
255 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  44.72 
 
 
256 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  42.04 
 
 
255 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  46.59 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  40.7 
 
 
257 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  46.18 
 
 
259 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  46.18 
 
 
259 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  45.69 
 
 
242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  39.7 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  43.44 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  54.37 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  39.7 
 
 
295 aa  138  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  41.53 
 
 
268 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  41.53 
 
 
268 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  41.53 
 
 
268 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  28.21 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  34.44 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  26.7 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  32.14 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  30.19 
 
 
120 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  23.98 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  36.73 
 
 
193 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>