More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3505 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  85.43 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  80.71 
 
 		 226 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  76.42 
 
 		 221 aa  332  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.33 
 
 		 223 aa  314  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  75.12 
 
 		 223 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  66.51 
 
 		 239 aa  290  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 225 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.08 
 
 		 222 aa  285  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.61 
 
 		 219 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.15 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.08 
 
 		 218 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  64.25 
 
 		 212 aa  272  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 231 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  61.14 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  64.25 
 
 		 212 aa  271  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.39 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.8 
 
 		 233 aa  267  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 215 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 215 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  62.14 
 
 		 216 aa  265  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  64 
 
 		 244 aa  261  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 213 aa  261  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.2 
 
 		 223 aa  260  8.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 216 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  61.65 
 
 		 218 aa  254  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.05 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.98 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 216 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  59.42 
 
 		 214 aa  241  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.94 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  61.84 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.39 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.86 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.06 
 
 		 242 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 241 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.44 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 253 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  39.42 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 222 aa  154  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 303 aa  154  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 218 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  41.83 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 137 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  37.44 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>