23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3484 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
439 aa  874  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  30.02 
 
 
429 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  32.41 
 
 
444 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  32.41 
 
 
444 aa  130  5e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  31.29 
 
 
442 aa  116  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  28.43 
 
 
339 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  32.76 
 
 
431 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  31.86 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  24.77 
 
 
545 aa  84.7  3e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  29.27 
 
 
320 aa  81.3  3e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  26.23 
 
 
477 aa  76.6  8e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  27.05 
 
 
320 aa  72.4  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  26.23 
 
 
482 aa  67.8  4e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  28.74 
 
 
556 aa  67.8  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  26.13 
 
 
518 aa  64.3  4e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.11 
 
 
515 aa  61.2  4e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  27.11 
 
 
473 aa  54.7  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1947  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
507 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.505699  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  32.58 
 
 
128 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
410 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 
255 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 
268 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
279 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>