72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3477 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  59.79 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  58.51 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  54.84 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  61.11 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  52.69 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  51.14 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  45.56 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  43.68 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  45.74 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  45.16 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  47.92 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  44.09 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  44.09 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  51.72 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  32.65 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  44.09 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  40.45 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  38.04 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  40.43 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  55.56 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  43.62 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 326 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  44.19 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  37.97 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  38.89 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  34.38 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  35.56 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  29.89 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  43.24 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  39.24 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  27.91 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 327 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 303 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 		 325 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 332 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  33.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  31.11 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  32.22 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 161 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  43.64 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>