166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3464 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  100 
 
 
527 aa  1050    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  61.95 
 
 
485 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  54.03 
 
 
506 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  50.11 
 
 
500 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  46.46 
 
 
507 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  46.61 
 
 
515 aa  422  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  47.06 
 
 
521 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  45.73 
 
 
541 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  46.43 
 
 
537 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  39.77 
 
 
524 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  44.64 
 
 
523 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  40.93 
 
 
521 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  39.56 
 
 
518 aa  359  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  44.73 
 
 
525 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  41.78 
 
 
515 aa  349  7e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  43.19 
 
 
542 aa  345  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  41.81 
 
 
508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  42.21 
 
 
522 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  41.81 
 
 
522 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  39.42 
 
 
542 aa  312  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  43.21 
 
 
540 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  39.48 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  39.48 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  39.48 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  42 
 
 
495 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  39.5 
 
 
525 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  40.32 
 
 
521 aa  299  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  40.12 
 
 
538 aa  296  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  35.95 
 
 
545 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  37.05 
 
 
495 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  35.59 
 
 
546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  40.36 
 
 
520 aa  289  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  38.02 
 
 
516 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  38.57 
 
 
533 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  38.57 
 
 
508 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  38.57 
 
 
508 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  39.47 
 
 
518 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  36.25 
 
 
520 aa  256  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  39.34 
 
 
557 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  36.74 
 
 
564 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  36.12 
 
 
505 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  33.68 
 
 
542 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  37.12 
 
 
535 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  32.24 
 
 
544 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.81 
 
 
535 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  36.58 
 
 
551 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  35.17 
 
 
571 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  33.76 
 
 
476 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  34.08 
 
 
530 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  32.85 
 
 
506 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  31.56 
 
 
504 aa  200  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  32.09 
 
 
505 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.8 
 
 
504 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  31.26 
 
 
505 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  33.07 
 
 
551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  33.26 
 
 
547 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  31.03 
 
 
499 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  28.3 
 
 
597 aa  183  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  33.84 
 
 
532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  33.19 
 
 
505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
555 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  31.86 
 
 
556 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.7 
 
 
546 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  44.44 
 
 
300 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  31.75 
 
 
508 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  30.56 
 
 
521 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  30.06 
 
 
515 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.3 
 
 
527 aa  166  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  41.95 
 
 
643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.65 
 
 
518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  31.14 
 
 
597 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.69 
 
 
478 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  30.11 
 
 
499 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  30.56 
 
 
504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30.69 
 
 
532 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
486 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.51 
 
 
486 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.44 
 
 
522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  32.29 
 
 
524 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.87 
 
 
750 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  29.03 
 
 
459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.15 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.39 
 
 
475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  31.5 
 
 
484 aa  147  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  27.62 
 
 
613 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.13 
 
 
494 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  27.47 
 
 
623 aa  137  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  27.56 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  28 
 
 
539 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  27.34 
 
 
514 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  30.28 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  29.74 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  30.29 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  32.8 
 
 
517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  30.42 
 
 
557 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  27.33 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  40.58 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  31.27 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  27.6 
 
 
566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>