102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3455 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  44.2 
 
 
382 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  46.72 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  40.87 
 
 
376 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  40.81 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.14 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  43.62 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.27 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.73 
 
 
402 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.32 
 
 
398 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33 
 
 
389 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 
432 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  40.74 
 
 
388 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  38.67 
 
 
390 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  40.27 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  27.75 
 
 
432 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  40.94 
 
 
420 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  32.12 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  37.93 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  33.82 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  42.96 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  35.19 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  38.06 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  38.06 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  38.06 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  38.56 
 
 
422 aa  94  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.91 
 
 
422 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33.56 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.95 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.2 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  31.51 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  35.67 
 
 
502 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  32.53 
 
 
414 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  40.14 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.42 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  28.84 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  32.87 
 
 
413 aa  86.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  35.42 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.18 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33.33 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  40.52 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  37.82 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  41.03 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  34.67 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  38.13 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  34.21 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  30.97 
 
 
416 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  30.97 
 
 
416 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  34 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  32.99 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  37.86 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  30.14 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  35.91 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  32.68 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  32.39 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  27.62 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  30.26 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  27.62 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  34.27 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  34.53 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  35 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  32.76 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  36.36 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  35.91 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  32.62 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  34.34 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  32.47 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  32.47 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  31.55 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  30.58 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  33.24 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  29.6 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  32.97 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  32.7 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  27.41 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  28.73 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  28.04 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  31.37 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  31.82 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  29.87 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  29.87 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  29.87 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  30.41 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  29.68 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  28.74 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  26.22 
 
 
1506 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  27.16 
 
 
430 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  34.67 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  29.37 
 
 
498 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
377 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  34.88 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
244 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
234 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  32.04 
 
 
344 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.581965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>