More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3438 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  100 
 
 
412 aa  826    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  78.14 
 
 
399 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  51.26 
 
 
408 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  51.62 
 
 
402 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  49.75 
 
 
410 aa  361  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  47.88 
 
 
405 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  49.22 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  46.06 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  41.25 
 
 
415 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  43.24 
 
 
398 aa  299  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.68 
 
 
402 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  43.14 
 
 
410 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.61 
 
 
401 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.35 
 
 
411 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  39.33 
 
 
414 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.9 
 
 
405 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  38.29 
 
 
415 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.26 
 
 
410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  37.68 
 
 
414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  43.1 
 
 
391 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  40 
 
 
387 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  39.07 
 
 
414 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  38.52 
 
 
407 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  41.16 
 
 
393 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  43.1 
 
 
411 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  40.91 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  41.96 
 
 
423 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  42.47 
 
 
414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.5 
 
 
436 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.04 
 
 
402 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.03 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  39.61 
 
 
414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  40.16 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.02 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  38.86 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  40.59 
 
 
429 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.52 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.26 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.78 
 
 
411 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  40.1 
 
 
417 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.44 
 
 
388 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.59 
 
 
419 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  39.49 
 
 
407 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.68 
 
 
412 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.28 
 
 
411 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.87 
 
 
398 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  39.46 
 
 
443 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.89 
 
 
407 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.89 
 
 
407 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.24 
 
 
420 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  37.53 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.89 
 
 
407 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.05 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.47 
 
 
411 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.47 
 
 
411 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.47 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.47 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  39.27 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.22 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.83 
 
 
398 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.65 
 
 
405 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.63 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.65 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.1 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.91 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.67 
 
 
417 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  38.35 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.18 
 
 
400 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  37.5 
 
 
390 aa  232  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.9 
 
 
408 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.04 
 
 
423 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.19 
 
 
400 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.07 
 
 
402 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  35.52 
 
 
400 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.36 
 
 
408 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  36.8 
 
 
418 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.68 
 
 
417 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  36.3 
 
 
429 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.09 
 
 
416 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.76 
 
 
404 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.01 
 
 
423 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40.43 
 
 
418 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  35.26 
 
 
399 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  36.52 
 
 
405 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  36.21 
 
 
408 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.97 
 
 
380 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.26 
 
 
414 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  36.06 
 
 
408 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  36.8 
 
 
410 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.94 
 
 
417 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.65 
 
 
419 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  37.97 
 
 
413 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  36.19 
 
 
414 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  41.96 
 
 
417 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.52 
 
 
406 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  36.65 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  32.83 
 
 
411 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  40.38 
 
 
419 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>