174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3353 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  69.22 
 
 		 545 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 543 aa  1065    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.25 
 
 		 526 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.13 
 
 		 505 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.57 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.3 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.27 
 
 		 534 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.84 
 
 		 553 aa  356  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.87 
 
 		 527 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.48 
 
 		 542 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.89 
 
 		 762 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 795 aa  333  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.59 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  45.41 
 
 		 614 aa  323  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.26 
 
 		 790 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.07 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.03 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  33.79 
 
 		 795 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.21 
 
 		 766 aa  303  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.01 
 
 		 776 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.9 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.04 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  40.09 
 
 		 736 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.87 
 
 		 618 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.74 
 
 		 779 aa  297  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.44 
 
 		 609 aa  297  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.24 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.84 
 
 		 634 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.01 
 
 		 533 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 		 775 aa  293  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.27 
 
 		 781 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 549 aa  290  6e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.59 
 
 		 905 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.41 
 
 		 785 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 		 772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.31 
 
 		 760 aa  282  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.36 
 
 		 812 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.14 
 
 		 812 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.78 
 
 		 821 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.44 
 
 		 655 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 		 774 aa  278  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  33.71 
 
 		 777 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 		 765 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  32.76 
 
 		 639 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  33.54 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 		 618 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  32.57 
 
 		 639 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 		 665 aa  246  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.13 
 
 		 493 aa  238  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 637 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.04 
 
 		 779 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 639 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.09 
 
 		 636 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.4 
 
 		 549 aa  233  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.01 
 
 		 834 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.51 
 
 		 688 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 		 547 aa  228  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.03 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 		 636 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 504 aa  222  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.99 
 
 		 639 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 		 688 aa  217  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.88 
 
 		 858 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.88 
 
 		 683 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 		 558 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 		 518 aa  213  7e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.04 
 
 		 584 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.7 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.87 
 
 		 673 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.93 
 
 		 866 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.07 
 
 		 673 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.65 
 
 		 797 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 		 852 aa  193  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 		 794 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.47 
 
 		 627 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.53 
 
 		 811 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.87 
 
 		 816 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.36 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.47 
 
 		 1140 aa  180  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.94 
 
 		 884 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  29.89 
 
 		 896 aa  176  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.86 
 
 		 863 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.45 
 
 		 676 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.19 
 
 		 868 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 		 479 aa  171  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 		 900 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 473 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.71 
 
 		 807 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.41 
 
 		 906 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.95 
 
 		 857 aa  163  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 		 896 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 		 820 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.18 
 
 		 778 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.03 
 
 		 888 aa  160  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>