243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3335 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 517 aa  996    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  47.74 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  47.67 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.2 
 
 		 501 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.63 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  30.84 
 
 		 536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  31.71 
 
 		 481 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  36.47 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  41.48 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.64 
 
 		 505 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 516 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.63 
 
 		 510 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  28.25 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  38.07 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.16 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  35.83 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  27.65 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.12 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  37.36 
 
 		 515 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  33.91 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  30.02 
 
 		 536 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 546 aa  90.1  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  29.28 
 
 		 566 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 586 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  38.51 
 
 		 535 aa  87  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.44 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 552 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  34.42 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  29.57 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.32 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  43.62 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.71 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.26 
 
 		 525 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.9 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  28.42 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.6 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  36 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.59 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  36 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  36 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  34 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.57 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.02 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.95 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.29 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  34.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.05 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.97 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  45.05 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  44.32 
 
 		 393 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 425 aa  67  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.62 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.48 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.24 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  37.67 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  37.67 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  37.67 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.67 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.67 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.67 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  34.76 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  37.37 
 
 		 616 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  29.49 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.49 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  32.76 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  37.12 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.44 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.27 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.19 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  41.98 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  35.07 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  27.43 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44.94 
 
 		 681 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40.54 
 
 		 493 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  37.37 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  39.77 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>