More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3334 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
439 aa  853    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  68.76 
 
 
432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  67.76 
 
 
433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 
437 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  50.11 
 
 
436 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  49.77 
 
 
437 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 
437 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  50.97 
 
 
436 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  50.73 
 
 
436 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  49.76 
 
 
436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  49.76 
 
 
436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  50.73 
 
 
436 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  49.76 
 
 
436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  48.68 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  49.03 
 
 
436 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  48.68 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  48.68 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  48.68 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  49.41 
 
 
427 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  48.44 
 
 
443 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  47.89 
 
 
443 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  49.64 
 
 
434 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  48.44 
 
 
443 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  48.48 
 
 
441 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  50.75 
 
 
437 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  46.87 
 
 
443 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  50.75 
 
 
437 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  50.75 
 
 
437 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 
434 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  50.75 
 
 
437 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  50.75 
 
 
437 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  50.75 
 
 
437 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  48.84 
 
 
439 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  44.65 
 
 
441 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  44.88 
 
 
441 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  44.88 
 
 
441 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  50.5 
 
 
437 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  45.69 
 
 
441 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  45.12 
 
 
441 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  48.37 
 
 
444 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  44.74 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  48.37 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  48.37 
 
 
457 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  48.37 
 
 
457 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  48.14 
 
 
444 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  45.69 
 
 
446 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  48.14 
 
 
457 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  48.14 
 
 
439 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  43.33 
 
 
433 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  45.93 
 
 
468 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.99 
 
 
437 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  47.37 
 
 
468 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  47.34 
 
 
474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.79 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  46.42 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  44.31 
 
 
444 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  43.82 
 
 
524 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  46.43 
 
 
482 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  46.44 
 
 
439 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  47.55 
 
 
481 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.95 
 
 
438 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  47.75 
 
 
461 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  46.6 
 
 
471 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  46.82 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  46.82 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  46.56 
 
 
470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.03 
 
 
450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.13 
 
 
437 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.28 
 
 
439 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.16 
 
 
439 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.88 
 
 
437 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.57 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.97 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  45.48 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.92 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.92 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.55 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.16 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.96 
 
 
430 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  43.2 
 
 
439 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  45.21 
 
 
470 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 
465 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  44.75 
 
 
443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.69 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.63 
 
 
457 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.63 
 
 
457 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.63 
 
 
457 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
461 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.34 
 
 
430 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  44.82 
 
 
430 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  39.96 
 
 
463 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>