More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3301 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  79.13 
 
 
428 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  81.71 
 
 
429 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  100 
 
 
416 aa  835    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  76.17 
 
 
419 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  73.22 
 
 
416 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  72.2 
 
 
413 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  71.46 
 
 
418 aa  549  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  67.48 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  65.53 
 
 
421 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  67.08 
 
 
420 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  66.67 
 
 
424 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  62.47 
 
 
425 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  62.96 
 
 
425 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  60.74 
 
 
418 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  62.32 
 
 
439 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  61.23 
 
 
428 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  60.74 
 
 
428 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  57.07 
 
 
414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  54.81 
 
 
454 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  55.56 
 
 
441 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  55.8 
 
 
437 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  55.42 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  55.42 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  54.55 
 
 
437 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  53.83 
 
 
434 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  54.68 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  54.81 
 
 
412 aa  434  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  55.15 
 
 
411 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  52.84 
 
 
408 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  53.4 
 
 
424 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  52.53 
 
 
426 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  45.57 
 
 
404 aa  331  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  36.67 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  34.9 
 
 
404 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  35.15 
 
 
403 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  34.81 
 
 
404 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  37.32 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  34.65 
 
 
404 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  34.61 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  34.29 
 
 
404 aa  239  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  36.05 
 
 
401 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.14 
 
 
401 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.24 
 
 
399 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.57 
 
 
401 aa  216  5e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  32.59 
 
 
402 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  32.27 
 
 
416 aa  213  7e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  35.66 
 
 
441 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.61 
 
 
422 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  34.28 
 
 
396 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  34.85 
 
 
419 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.44 
 
 
427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  34.79 
 
 
423 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  35.03 
 
 
419 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  36.29 
 
 
459 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  35.05 
 
 
402 aa  189  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.73 
 
 
403 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  33.42 
 
 
408 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  37.16 
 
 
346 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.78 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  35.32 
 
 
397 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.99 
 
 
346 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  30.41 
 
 
432 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
545 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  30.15 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.06 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  38.92 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  35.48 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.43 
 
 
351 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.84 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  34.93 
 
 
352 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.33 
 
 
349 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  34.62 
 
 
352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  32.96 
 
 
352 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.08 
 
 
394 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  35.03 
 
 
348 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  34.32 
 
 
352 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  34.32 
 
 
352 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  34.75 
 
 
356 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  29.8 
 
 
402 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.44 
 
 
391 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  32.46 
 
 
408 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  34.32 
 
 
352 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  34.32 
 
 
352 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  34.73 
 
 
348 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  35.09 
 
 
348 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  34.86 
 
 
404 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  34.02 
 
 
352 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  33.13 
 
 
351 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  38.58 
 
 
370 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  34.32 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  37.04 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  34.32 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  31.69 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  34.62 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  34.13 
 
 
353 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  34.13 
 
 
353 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  33.76 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  34.63 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  37.87 
 
 
345 aa  166  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 
375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>