More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3251 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 427 aa  860    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  48.64 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  44.5 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 		 434 aa  278  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  40.5 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  37.95 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.63 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  38.12 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  37.16 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  33.79 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  36.39 
 
 		 427 aa  252  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  35.48 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  35.03 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  34.34 
 
 		 427 aa  233  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  35.37 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  35.98 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 436 aa  199  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 		 451 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 444 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 441 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  32.44 
 
 		 434 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.55 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.15 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 439 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.53 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27.25 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  29.02 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  33.59 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.58 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.49 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28.63 
 
 		 443 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.62 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.33 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.75 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.99 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  31.05 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  28.69 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>