More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3154 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
326 aa  670    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  86.11 
 
 
325 aa  590  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.77 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.15 
 
 
325 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.34 
 
 
322 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.03 
 
 
326 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.09 
 
 
322 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.68 
 
 
325 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.28 
 
 
324 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.89 
 
 
324 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.62 
 
 
326 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.94 
 
 
347 aa  461  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.69 
 
 
326 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.85 
 
 
326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.69 
 
 
334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.56 
 
 
323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.52 
 
 
327 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.83 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.11 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.46 
 
 
326 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.89 
 
 
327 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.19 
 
 
325 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.47 
 
 
325 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.01 
 
 
327 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.03 
 
 
326 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.72 
 
 
326 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.3 
 
 
324 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.35 
 
 
326 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.04 
 
 
326 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.72 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.41 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.09 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.09 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.09 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.02 
 
 
327 aa  411  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.11 
 
 
326 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  60.25 
 
 
344 aa  394  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.85 
 
 
337 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  55.59 
 
 
337 aa  388  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.73 
 
 
316 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
323 aa  363  3e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.1 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.14 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.69 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
317 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
331 aa  316  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.23 
 
 
331 aa  311  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  47.59 
 
 
317 aa  311  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
318 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 
319 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
318 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.28 
 
 
321 aa  309  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.43 
 
 
327 aa  309  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.05 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
331 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.62 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.3 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.18 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.4 
 
 
313 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
318 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.54 
 
 
329 aa  301  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
311 aa  300  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.43 
 
 
359 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
322 aa  299  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
321 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
325 aa  296  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.51 
 
 
326 aa  296  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.89 
 
 
321 aa  295  6e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 
331 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.15 
 
 
316 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 
331 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.96 
 
 
331 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.96 
 
 
331 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 
331 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.96 
 
 
322 aa  292  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  49.04 
 
 
312 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
330 aa  292  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 
314 aa  292  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>