More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3152 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  78.12 
 
 		 201 aa  317  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  62.89 
 
 		 198 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  64.67 
 
 		 197 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  65.03 
 
 		 189 aa  258  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  67.03 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  63.59 
 
 		 195 aa  251  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  65.59 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  63.84 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  66.3 
 
 		 206 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  59.38 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  63.78 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  63.78 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  60.21 
 
 		 217 aa  235  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  63.35 
 
 		 202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.1 
 
 		 196 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  59.6 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  63.24 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  55.98 
 
 		 192 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  59.38 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  64.32 
 
 		 191 aa  212  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  56.37 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  57.51 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  55.98 
 
 		 192 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  59.36 
 
 		 195 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  61.08 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  56.57 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  56.25 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  54.05 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  57.73 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  52.17 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  52.72 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  55.44 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  48.63 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  48.91 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  43.88 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  44.56 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  45.5 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 193 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.26 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 232 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 		 193 aa  147  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.08 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  47.27 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>