85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3119 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
329 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  75.5 
 
 
324 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  58.31 
 
 
343 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  51.85 
 
 
348 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  52.94 
 
 
361 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  52.76 
 
 
361 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  54.8 
 
 
376 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  49.24 
 
 
347 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  52.01 
 
 
351 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  57.56 
 
 
340 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  47.67 
 
 
305 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  46.25 
 
 
298 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  46.43 
 
 
348 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  40.53 
 
 
368 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  44.22 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  43.56 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  43.85 
 
 
318 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.85 
 
 
318 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  43.44 
 
 
318 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  44.26 
 
 
320 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  39.92 
 
 
314 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  49.22 
 
 
270 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  50 
 
 
270 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  42.71 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.53 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.53 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  33.53 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.53 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.53 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.53 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.94 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  31.25 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  38.66 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  36.97 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  32.6 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  32.6 
 
 
235 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  32.6 
 
 
235 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  21.94 
 
 
196 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.91 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  29.94 
 
 
240 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  20.51 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.03 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  29.94 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  35.58 
 
 
240 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  31.95 
 
 
235 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  34.97 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  33.66 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  27.39 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  21.61 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.95 
 
 
219 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  31.19 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.38 
 
 
210 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  28.78 
 
 
300 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  21.61 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  21.11 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  30.24 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  21.11 
 
 
197 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  21.11 
 
 
197 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  31.82 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  35.45 
 
 
210 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  24.28 
 
 
246 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  20.6 
 
 
197 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  20.9 
 
 
197 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.75 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1718  lipolytic protein G-D-S-L family  27.89 
 
 
270 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  29.61 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  28.72 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  27.23 
 
 
297 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 
216 aa  46.2  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  28.3 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  23.88 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  31.22 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  32.84 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  24.12 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  26.43 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  27.33 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  28.64 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.08 
 
 
238 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  26 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  27.86 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  28.67 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  24.17 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>