More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3095 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  100 
 
 		 452 aa  882    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  56.39 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 393 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.11 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  52.54 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  58.72 
 
 		 374 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  54.78 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  52.63 
 
 		 321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 204 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  50.93 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.46 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  48.67 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  50 
 
 		 394 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  54.21 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.27 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  49.06 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  47.29 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 337 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  49.52 
 
 		 392 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.5 
 
 		 235 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  46.9 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.53 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  46.67 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 350 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  47.62 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  47.11 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.7 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 162 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  47.58 
 
 		 308 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  51.61 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.05 
 
 		 176 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.15 
 
 		 1048 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.22 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 317 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 319 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 495 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  48.54 
 
 		 281 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 180 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 345 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 327 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 		 556 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  50 
 
 		 501 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 363 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  34.42 
 
 		 333 aa  97.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 378 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 363 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 517 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  43.14 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.54 
 
 		 475 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.35 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.5 
 
 		 340 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 228 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 625 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.47 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 306 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  39.34 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 227 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.31 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 265 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.34 
 
 		 330 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  40.98 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 230 aa  94  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 		 318 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 502 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 175 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 347 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 259 aa  93.2  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 348 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>