More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3027 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 359 aa  707    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  83.29 
 
 		 359 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  77.03 
 
 		 370 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  76.31 
 
 		 363 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  71.99 
 
 		 368 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.66 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.55 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  66.57 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.48 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  63.69 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  68.27 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.61 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.64 
 
 		 618 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  63.97 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.37 
 
 		 328 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.64 
 
 		 330 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.72 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.64 
 
 		 330 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.34 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.15 
 
 		 368 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  61.89 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  62.18 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  64.25 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  58.92 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.27 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  57.38 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.76 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.95 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  57.95 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.52 
 
 		 285 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  58.4 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  57.67 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  58.2 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  51.31 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  59.73 
 
 		 382 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.65 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  42.36 
 
 		 396 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  42.07 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  41.25 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  39.34 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  35.12 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  35.17 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  42.09 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  30.34 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  32.55 
 
 		 392 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  35.93 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.89 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.89 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.84 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  34.83 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.83 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.37 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.87 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  34.37 
 
 		 409 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 		 400 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.66 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  35.79 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  35.2 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.92 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.25 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  34.24 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  35.19 
 
 		 460 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.45 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.05 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  34.78 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.71 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  33.97 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  32.38 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.37 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  33.43 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.97 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  32.23 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.66 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.7 
 
 		 407 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  35.03 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  34.15 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  35.04 
 
 		 401 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  32.89 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  32.23 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.85 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  32.4 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  31.55 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  32.13 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.84 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  35.73 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  31.95 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  32.06 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  32.74 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  31.95 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  31.95 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.83 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 399 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>