69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2998 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  70 
 
 
293 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  61.64 
 
 
312 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  61.67 
 
 
276 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  49.5 
 
 
279 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  53.18 
 
 
287 aa  271  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  51.68 
 
 
302 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  50.16 
 
 
302 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  59.17 
 
 
284 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  49.84 
 
 
286 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.44 
 
 
304 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  27.21 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  26.49 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  30.88 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  27.27 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  28.03 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.51 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  28.03 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  22.61 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  28.81 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  23.66 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  22.83 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  25.39 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  23.2 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  28.77 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  22.48 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  25.69 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  26.53 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  27.53 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  27.91 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  27.91 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  27.91 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  27.12 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  27.62 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  28 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  29.05 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  27.27 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.03 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  27.92 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  30.85 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  26.48 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  21.67 
 
 
1019 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  26.62 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.95 
 
 
781 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  26.03 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  27.85 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  25.66 
 
 
351 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.63 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.86 
 
 
780 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  19.52 
 
 
411 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  26.95 
 
 
387 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 
1052 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  22.77 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  26.42 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  25.86 
 
 
781 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  20.65 
 
 
794 aa  45.8  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 
1051 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1926  hypothetical protein  22.84 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00847839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 
1051 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 
1051 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.55 
 
 
1106 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  32.53 
 
 
1197 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 
1038 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 
1192 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  45.61 
 
 
991 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.29 
 
 
1051 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 
1038 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  36.99 
 
 
1183 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.59 
 
 
1083 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>