264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2959 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  86.47 
 
 
171 aa  292  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  67.27 
 
 
191 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  63.86 
 
 
180 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  63.03 
 
 
203 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  72.3 
 
 
174 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  58.99 
 
 
210 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  62.33 
 
 
258 aa  191  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  60.14 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  66.04 
 
 
170 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  63.98 
 
 
184 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  58.86 
 
 
175 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  58.28 
 
 
173 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  58.54 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  54.79 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  56.95 
 
 
172 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  58.39 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  57.62 
 
 
172 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  55.19 
 
 
178 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  57.64 
 
 
208 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  53.74 
 
 
220 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  49.37 
 
 
164 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  50.88 
 
 
211 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  47.17 
 
 
211 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  47.62 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  44.79 
 
 
198 aa  126  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  39.73 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  33.59 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  38.36 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  43.18 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  27.97 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  45.45 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  37.5 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  45.07 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  40.79 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  35.06 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  31.98 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  31.71 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  50.88 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  31.21 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  35.2 
 
 
279 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  33.59 
 
 
251 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  49.37 
 
 
268 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  47.73 
 
 
241 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  32.52 
 
 
196 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  41.1 
 
 
247 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  32.43 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  37.08 
 
 
238 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  45.45 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  43.4 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  37.39 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  41.33 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  29.66 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  33.09 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  27.16 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  42.67 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  39.18 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  51.85 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  40 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  34.78 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  41.67 
 
 
292 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  32.11 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  37.4 
 
 
286 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  41.33 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  41.33 
 
 
255 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  47.69 
 
 
285 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  38.1 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  38.89 
 
 
244 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  39.53 
 
 
295 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  35.04 
 
 
239 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  23.13 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  40.58 
 
 
141 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  47.69 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  49.18 
 
 
292 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  37.78 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  46.15 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  45.61 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  36.07 
 
 
278 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  46.15 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  32.61 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  46.15 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  46.15 
 
 
295 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  39.29 
 
 
303 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  32.95 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.61 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  40.85 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>