58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2950 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  43.6 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  44.14 
 
 
369 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  49.28 
 
 
375 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  40.34 
 
 
367 aa  281  9e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  41.29 
 
 
369 aa  281  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  44.38 
 
 
362 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  46.89 
 
 
355 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  40.45 
 
 
366 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  41.87 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  41.27 
 
 
365 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  43.66 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  38.67 
 
 
366 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  41.83 
 
 
372 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  41.95 
 
 
366 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  38.32 
 
 
367 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  40.91 
 
 
361 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  42.77 
 
 
390 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  41.82 
 
 
362 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  39.72 
 
 
360 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  36.62 
 
 
381 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  37.03 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  38.34 
 
 
362 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  34.78 
 
 
360 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  35.83 
 
 
374 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  42.2 
 
 
362 aa  209  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  40.25 
 
 
367 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  38.29 
 
 
357 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  42.9 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  33.05 
 
 
371 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  40.33 
 
 
381 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  35.33 
 
 
370 aa  170  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  37.61 
 
 
354 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  30.33 
 
 
369 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  30.03 
 
 
999 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  30.63 
 
 
348 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  27.27 
 
 
369 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  26.96 
 
 
371 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  28.34 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 
994 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  28.19 
 
 
983 aa  132  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  27.55 
 
 
373 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  30 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  27.74 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  32.65 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  24.59 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  29.81 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  27.27 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  28.4 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  28.06 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  26.85 
 
 
409 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  28.28 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  28.28 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  28.15 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  23.03 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  27.84 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>