63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2899 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  917    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  62.75 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  45.34 
 
 		 478 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  42.8 
 
 		 447 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  39.37 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  38.84 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  40.94 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  34.55 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  34.18 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  32.48 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  32.43 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  34.58 
 
 		 524 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  34.18 
 
 		 449 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  28.53 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  30.14 
 
 		 579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  30.65 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.51 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  27.56 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.3 
 
 		 477 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  28.85 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 530 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  51.65 
 
 		 221 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  30.12 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  30.92 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  29.9 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.8 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  28.67 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  31.86 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  26.32 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  26.86 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  29.73 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  32.09 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  31.13 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  29.66 
 
 		 311 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  28.82 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  24.75 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  26.88 
 
 		 537 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  28.46 
 
 		 288 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1605  hypothetical protein  48.94 
 
 		 116 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  27.35 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  25.81 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  27.65 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  28.37 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.27 
 
 		 418 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  30.67 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  27.31 
 
 		 565 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  27.07 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  24.76 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  27.54 
 
 		 518 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1018 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  33.67 
 
 		 346 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>