More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2888 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 368 aa  745    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  72.05 
 
 		 348 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  54.91 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  46.51 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  45.59 
 
 		 363 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  45.14 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 		 332 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  42.99 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.01 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 323 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  34.37 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  30.24 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  34.06 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  33.13 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  33.13 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.15 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.36 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  31.16 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 330 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  28.22 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  32.15 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  30.95 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.89 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.6 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  29.43 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.63 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  24.85 
 
 		 317 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  24.85 
 
 		 317 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 318 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  30.42 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.75 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  27.87 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.8 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  30.15 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  30.58 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  29.84 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.1 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 288 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  27.97 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  26.38 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  29.5 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  31.47 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  29.48 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>