More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2863 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  62.79 
 
 		 570 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  58.65 
 
 		 569 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.79 
 
 		 566 aa  811    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 563 aa  1125    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.43 
 
 		 562 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.55 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.42 
 
 		 651 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.66 
 
 		 593 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.66 
 
 		 593 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.66 
 
 		 593 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  45.75 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  42.94 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.76 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.95 
 
 		 594 aa  333  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.43 
 
 		 595 aa  306  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 		 590 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.48 
 
 		 649 aa  276  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.64 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  40.67 
 
 		 834 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.91 
 
 		 831 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.95 
 
 		 834 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  33.53 
 
 		 608 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.4 
 
 		 834 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  33.66 
 
 		 611 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3924  signal peptide peptidase A  51.39 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.56 
 
 		 604 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.13 
 
 		 585 aa  256  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.4 
 
 		 640 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.77 
 
 		 629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 		 589 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.67 
 
 		 587 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.94 
 
 		 605 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  32.6 
 
 		 583 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  33.46 
 
 		 609 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  34.96 
 
 		 633 aa  246  8e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.54 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.53 
 
 		 875 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 		 633 aa  239  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  33.6 
 
 		 555 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.8 
 
 		 595 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.34 
 
 		 571 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 		 613 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  32.76 
 
 		 566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  35.77 
 
 		 536 aa  234  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  34.27 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.28 
 
 		 588 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.1 
 
 		 598 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.1 
 
 		 598 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.47 
 
 		 614 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.65 
 
 		 614 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  31.68 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  31.95 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  33.2 
 
 		 616 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.47 
 
 		 614 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  32.29 
 
 		 616 aa  226  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.75 
 
 		 613 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.77 
 
 		 615 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.77 
 
 		 615 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.58 
 
 		 615 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.87 
 
 		 614 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.58 
 
 		 615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.55 
 
 		 615 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  31.62 
 
 		 617 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.26 
 
 		 617 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.66 
 
 		 561 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.95 
 
 		 617 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  34.49 
 
 		 583 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.54 
 
 		 656 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.1 
 
 		 616 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  35.03 
 
 		 580 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.06 
 
 		 613 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.36 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  30.81 
 
 		 612 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  33.05 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.62 
 
 		 637 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.86 
 
 		 614 aa  213  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.08 
 
 		 621 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  31.86 
 
 		 618 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.06 
 
 		 596 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  31.9 
 
 		 618 aa  206  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  31.3 
 
 		 601 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.58 
 
 		 613 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  31.03 
 
 		 618 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  31.03 
 
 		 618 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  31.03 
 
 		 622 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  31.03 
 
 		 618 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  30.62 
 
 		 618 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  30.62 
 
 		 618 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  30.42 
 
 		 618 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  30.42 
 
 		 618 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  31.03 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  31.24 
 
 		 621 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  31.03 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.03 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  30.22 
 
 		 618 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  30.74 
 
 		 618 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.69 
 
 		 617 aa  200  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  30.83 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.46 
 
 		 597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 		 620 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>