227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2762 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  70.89 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  50.69 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  54.98 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  52.36 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  51.55 
 
 		 196 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  45.37 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  46.53 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 195 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  48.13 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.37 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  29.9 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  38.96 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  40.7 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  32.91 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 259 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  26.26 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>