More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2728 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  55.29 
 
 		 696 aa  751    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  53.82 
 
 		 705 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  52.65 
 
 		 703 aa  720    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  52.65 
 
 		 703 aa  720    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 699 aa  1421    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  49.09 
 
 		 708 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  41.14 
 
 		 685 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  38.27 
 
 		 711 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.66 
 
 		 737 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  33.71 
 
 		 712 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  46.39 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  37.48 
 
 		 687 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  33.05 
 
 		 706 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  39.36 
 
 		 659 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  34.04 
 
 		 704 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.04 
 
 		 704 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  44.88 
 
 		 679 aa  365  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  34.04 
 
 		 704 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  34.08 
 
 		 705 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 714 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  35.14 
 
 		 759 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  34.09 
 
 		 752 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  32.4 
 
 		 821 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  31.11 
 
 		 683 aa  316  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  33.33 
 
 		 717 aa  294  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 737 aa  293  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  31.92 
 
 		 662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.27 
 
 		 696 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  31.11 
 
 		 716 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  30.79 
 
 		 673 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 690 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  33.4 
 
 		 734 aa  183  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  32.18 
 
 		 809 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29.77 
 
 		 700 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 710 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.14 
 
 		 712 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 695 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 695 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  24.49 
 
 		 815 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.7 
 
 		 819 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.36 
 
 		 1107 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 663 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 671 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 508 aa  99.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  30.43 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  28.68 
 
 		 619 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  29.41 
 
 		 615 aa  88.2  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  28.29 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.42 
 
 		 689 aa  84.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  27.96 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 564 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 682 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  30.23 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.3 
 
 		 710 aa  77.4  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  28.46 
 
 		 612 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.83 
 
 		 721 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.89 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  29.81 
 
 		 607 aa  74.7  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  28.09 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 1033 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 		 1244 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.1 
 
 		 739 aa  72  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.32 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 		 709 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  25.13 
 
 		 709 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  28.17 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  40.48 
 
 		 684 aa  72  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.58 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  21.18 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  27.27 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.05 
 
 		 858 aa  70.5  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1127 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.11 
 
 		 728 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  26.46 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 845 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.43 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  26.46 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.39 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  27.82 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.67 
 
 		 794 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25.29 
 
 		 613 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  25.77 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 744 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  40.48 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  40.48 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.36 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  40.48 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2706  UvrD/REP helicase  23 
 
 		 704 aa  67.4  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.341733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  22.95 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>