More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2696 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  76.06 
 
 		 194 aa  297  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  67.82 
 
 		 204 aa  262  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  65.05 
 
 		 213 aa  247  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 219 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.32 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
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NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
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NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.9 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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