More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2607 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  100 
 
 
558 aa  1102    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  54.94 
 
 
564 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  54.36 
 
 
561 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  53.1 
 
 
549 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  52.98 
 
 
565 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  52.54 
 
 
557 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  52.98 
 
 
565 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  52.53 
 
 
564 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  51.01 
 
 
548 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  51.09 
 
 
558 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 
559 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  52.74 
 
 
572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  50 
 
 
552 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  50 
 
 
555 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  50.99 
 
 
575 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  48.44 
 
 
550 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  49.55 
 
 
570 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  50.73 
 
 
576 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50.18 
 
 
568 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  51.25 
 
 
575 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  53.51 
 
 
558 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  51.16 
 
 
581 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  50.99 
 
 
567 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  48.92 
 
 
574 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  48.73 
 
 
566 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  50.56 
 
 
556 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  50.73 
 
 
552 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  49.54 
 
 
572 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  51 
 
 
567 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  51.37 
 
 
552 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  49.18 
 
 
559 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  50.09 
 
 
559 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  50.81 
 
 
567 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  50.81 
 
 
567 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  51.09 
 
 
567 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  50.64 
 
 
567 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  52.68 
 
 
553 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  50.46 
 
 
582 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  50.82 
 
 
567 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  51.9 
 
 
556 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  51 
 
 
567 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  48.75 
 
 
567 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.82 
 
 
559 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.25 
 
 
570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.63 
 
 
572 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  48.28 
 
 
559 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  49.53 
 
 
583 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  47.35 
 
 
580 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  49 
 
 
567 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  49.18 
 
 
567 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  47 
 
 
551 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  48.99 
 
 
561 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  48.46 
 
 
566 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  47.67 
 
 
564 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  46.77 
 
 
567 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  45.94 
 
 
538 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.9 
 
 
572 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  45.47 
 
 
568 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  41.21 
 
 
552 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  39.31 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  40.56 
 
 
543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.98 
 
 
565 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  39.16 
 
 
586 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.88 
 
 
561 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  40.07 
 
 
587 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.86 
 
 
560 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.34 
 
 
543 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.76 
 
 
564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  30.47 
 
 
547 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.81 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
572 aa  246  9e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  32.9 
 
 
556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
552 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.87 
 
 
569 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.09 
 
 
588 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.91 
 
 
593 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  32.46 
 
 
583 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.65 
 
 
574 aa  237  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.73 
 
 
566 aa  236  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.06 
 
 
572 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 
569 aa  236  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.23 
 
 
555 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.73 
 
 
618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.95 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.43 
 
 
554 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.09 
 
 
602 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
554 aa  233  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.07 
 
 
563 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.27 
 
 
557 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  30.12 
 
 
572 aa  232  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.81 
 
 
566 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.35 
 
 
558 aa  230  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.65 
 
 
561 aa  230  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>