More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2588 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  54.08 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  42.68 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.14 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  47.99 
 
 		 308 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  45.48 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  44.48 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  42.9 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.07 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.12 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.47 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.83 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  46 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  46.49 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  46 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  46.08 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.76 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.19 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  45.73 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  47.67 
 
 		 318 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  42.81 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.96 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  44.04 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  45.25 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  42.42 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  45.6 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  37.41 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  41.2 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  37.41 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  42.09 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40.13 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.83 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  42.71 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  46 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  42.96 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  37.84 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.65 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.2 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  36.21 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.8 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  45.67 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.56 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  45.67 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  41.14 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  38 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  43.45 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38.7 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  40.96 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36.03 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.45 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  38.61 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.46 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  43.79 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  41.98 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.68 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.54 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.94 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.14 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.7 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.42 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.73 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.61 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.38 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  37.07 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.38 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.38 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.86 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  45.05 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  37.07 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  37.41 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  42.67 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  38.72 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  38.59 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  36.27 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  43.42 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  41.67 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4825  PfkB domain protein  51.54 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  37.07 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  37.07 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  44.22 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  37.07 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  45.05 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  45.05 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.95 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  38.72 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.72 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.72 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  38.46 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  36.39 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1072  PfkB  46.58 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.72 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.72 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  38.46 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  32.99 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  37.41 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  38.03 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.38 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>