225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2574 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  40.72 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  45.16 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 193 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  39.7 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 383 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  36.98 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.53 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  32 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  35.75 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  34.25 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  36.6 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  26.87 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  42.2 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.14 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  34.97 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.13 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  47.62 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  40.46 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>