50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2547 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1095    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  67.82 
 
 		 518 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  54.26 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  32.21 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  31.57 
 
 		 477 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  25.86 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  26.14 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  30.46 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  29.95 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  27.15 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  27.12 
 
 		 505 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  27.8 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  27.67 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  26.11 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  30.92 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  24.8 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  34.2 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  25.74 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  30.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  25.69 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  27.46 
 
 		 429 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  27.39 
 
 		 320 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 488 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  25.09 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  30 
 
 		 316 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  27.84 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  27.16 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  32.93 
 
 		 345 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  23.43 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  26.1 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  28.41 
 
 		 320 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 460 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.32 
 
 		 418 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  31.53 
 
 		 128 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  31.43 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  34.95 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  29.64 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>