More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2505 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  71.21 
 
 		 409 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  42.51 
 
 		 403 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  42.16 
 
 		 368 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2948  putative phage integrase  61.17 
 
 		 110 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  32.28 
 
 		 389 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  37.82 
 
 		 370 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.33 
 
 		 374 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.33 
 
 		 374 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  36.79 
 
 		 387 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  31.73 
 
 		 413 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  38.78 
 
 		 385 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  36.82 
 
 		 463 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  35.42 
 
 		 370 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  34.54 
 
 		 435 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 391 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  33.17 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  36.84 
 
 		 383 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.73 
 
 		 390 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  36.07 
 
 		 477 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  34.03 
 
 		 378 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.42 
 
 		 391 aa  98.6  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  33.51 
 
 		 442 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  35.12 
 
 		 377 aa  98.6  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 393 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  34 
 
 		 416 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  37.43 
 
 		 422 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  35.79 
 
 		 325 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  35.96 
 
 		 431 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  36.87 
 
 		 363 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  30.81 
 
 		 384 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.84 
 
 		 386 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  35.75 
 
 		 379 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 388 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  34.34 
 
 		 377 aa  91.3  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 383 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  30.57 
 
 		 381 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  35.36 
 
 		 487 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  35.39 
 
 		 402 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  35.39 
 
 		 422 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  33.15 
 
 		 367 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  31 
 
 		 369 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.84 
 
 		 381 aa  88.2  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  31.66 
 
 		 369 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  34.41 
 
 		 378 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  36.18 
 
 		 471 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  36.18 
 
 		 471 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 376 aa  85.1  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  30.1 
 
 		 392 aa  84.7  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.28 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  30.65 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  35.32 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  32.79 
 
 		 374 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  30.73 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  32.82 
 
 		 460 aa  81.6  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  32.97 
 
 		 379 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 379 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  33.51 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  33.88 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  31.31 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  32.83 
 
 		 400 aa  78.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  33.71 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.77 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  30.88 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.13 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  32.79 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.13 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  39.13 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.67 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  33 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.9 
 
 		 416 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  31.31 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.33 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.29 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  33.85 
 
 		 458 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  27.98 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  34.64 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.87 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  31.69 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  29.77 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.75 
 
 		 506 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  32.96 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  33.66 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  33.15 
 
 		 492 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.14 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.83 
 
 		 421 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  31.87 
 
 		 324 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  29.35 
 
 		 392 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  30.18 
 
 		 387 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  31.96 
 
 		 656 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  28.64 
 
 		 398 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  31.22 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.83 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.35 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>