More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2464 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 386 aa  768    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  65.61 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  55.87 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  48.56 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  47.38 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  49.73 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  47.57 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  45.52 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  47.66 
 
 		 407 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  42.55 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  47.03 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  38.13 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  41.51 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35.54 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  32.87 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  39.24 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.51 
 
 		 412 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  39.01 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  36.83 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.7 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.01 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.49 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.49 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.62 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  33.42 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  38.17 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.84 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  36.51 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.32 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.18 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  36.29 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  35.58 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  38.8 
 
 		 366 aa  196  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  36.04 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  36.89 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  34.79 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  32.42 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.9 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.12 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  35.62 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  34.34 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  35.49 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  36.11 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  38.08 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.56 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  36.18 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.34 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.21 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  33.42 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.87 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  34.93 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.61 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  33.69 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  35.52 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.64 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  33.6 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  35.42 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  35.42 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  34.5 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  35.15 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  34.04 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35.93 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  33.15 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  35.17 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>