More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2461 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  72.9 
 
 		 1151 aa  742    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  75.15 
 
 		 1334 aa  802    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  69.29 
 
 		 1091 aa  707    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  75.87 
 
 		 1018 aa  718    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  68.29 
 
 		 1024 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  80.45 
 
 		 908 aa  796    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  71.06 
 
 		 959 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  81.48 
 
 		 1007 aa  813    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  65.3 
 
 		 987 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  74.05 
 
 		 1048 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  75.73 
 
 		 1427 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  74.2 
 
 		 944 aa  732    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  75.63 
 
 		 1194 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  66.87 
 
 		 1040 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  73.18 
 
 		 952 aa  733    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  70.24 
 
 		 1093 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  73.77 
 
 		 1244 aa  691    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  70.79 
 
 		 974 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  63.74 
 
 		 717 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  64.13 
 
 		 953 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  63.41 
 
 		 1016 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  76.45 
 
 		 1265 aa  762    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  65.3 
 
 		 991 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 990 aa  1947    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  77.11 
 
 		 1043 aa  735    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  77.01 
 
 		 1117 aa  748    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  74.02 
 
 		 1113 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  69.82 
 
 		 1058 aa  703    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  67 
 
 		 1041 aa  841    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  81.56 
 
 		 922 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  76.92 
 
 		 702 aa  723    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  71.02 
 
 		 1070 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  67.17 
 
 		 1080 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  65.3 
 
 		 991 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  64.38 
 
 		 961 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  63.52 
 
 		 1022 aa  610  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  61.04 
 
 		 1093 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  45.23 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  46.95 
 
 		 559 aa  364  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  47 
 
 		 636 aa  356  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  48.05 
 
 		 564 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  46.3 
 
 		 562 aa  347  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  43.13 
 
 		 494 aa  344  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  43.57 
 
 		 492 aa  338  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  45.65 
 
 		 411 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.8 
 
 		 496 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.8 
 
 		 496 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  41.21 
 
 		 531 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  45.17 
 
 		 571 aa  322  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  40.09 
 
 		 543 aa  320  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  42.59 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  44.12 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.09 
 
 		 483 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  42.59 
 
 		 497 aa  318  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.92 
 
 		 496 aa  317  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  39.66 
 
 		 503 aa  317  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  45.48 
 
 		 497 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.7 
 
 		 496 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  42.52 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  45.11 
 
 		 490 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  41.18 
 
 		 503 aa  314  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.81 
 
 		 485 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  44.03 
 
 		 489 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.65 
 
 		 500 aa  310  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  40.6 
 
 		 501 aa  310  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  40.04 
 
 		 530 aa  310  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.32 
 
 		 485 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  41.93 
 
 		 495 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  43.78 
 
 		 489 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  43.78 
 
 		 489 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  41.93 
 
 		 495 aa  308  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  47.75 
 
 		 485 aa  307  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  46.5 
 
 		 492 aa  307  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  47.75 
 
 		 485 aa  307  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  47.75 
 
 		 485 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  39.27 
 
 		 1132 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  46.25 
 
 		 485 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  45.19 
 
 		 487 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40.75 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  40.99 
 
 		 483 aa  306  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  43.63 
 
 		 489 aa  306  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  46.25 
 
 		 485 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  39.27 
 
 		 1132 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  45.54 
 
 		 493 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.02 
 
 		 492 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  44.8 
 
 		 482 aa  305  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  47.25 
 
 		 485 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  39.57 
 
 		 938 aa  304  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  43.52 
 
 		 489 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  42.41 
 
 		 496 aa  303  9e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  42.79 
 
 		 484 aa  303  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  39.59 
 
 		 508 aa  303  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  43.07 
 
 		 474 aa  301  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  43.03 
 
 		 489 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37.8 
 
 		 528 aa  301  4e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.94 
 
 		 1056 aa  301  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  40.66 
 
 		 517 aa  300  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  38.76 
 
 		 1073 aa  300  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  39.7 
 
 		 476 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  37.98 
 
 		 1238 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>